تعتبر كلية الدراسات العليا والبحث العلمي بجامعة القرآن الكريم والعلوم الإسلامية أحد أهم كليات الجامعة المختلفة ، حيث أنشئت في عام 1411هـ الموافق له 1991م .
تمنح الكلية الدرجات العلمية التالية :
- درجة الدبلوم العالي – درجة الماجستير – درجة الدكتوراه
أولاً: تخصصات الماجستير والدكتوراه: وتحتوي على الآتي:
- دائرة العلوم الشرعية وتحتوي على التخصصات التالية :
(التفسير وعلوم القرآن ، الحديث وعلومه ، الفقه المقارن ، الفقه الإسلامي ، أصول الفقه ، العقيدة).
-دائرة القراءات .
- دائرة اللغة العربية وتحتوي على التخصصات التالية : (النحو والصرف ، الأدب العربي ، البلاغة ، علم اللغة) .
- دائرة الدعوة والإعلام وتحتوي على التخصصات التالية : (الدعوة ، الإذاعة والتلفزيون ، الصحافة والنشر ، الاتصال والعلاقات العامة)
- دائرة العلوم الإدارية وتحتوي على تخصص الإدارة العامة .
- دائرة العلوم الاقتصادية وتحتوي على تخصص الاقتصاد .
- دائرة العلوم التربوية وتحتوي على التخصصات التالية : (أصول التربية ، المناهج وطرق التدريس ، الإدارة التربوية ، فلسفة التربية ، علم النفس التربوي) .
ثانياً: الدبلومات العليا وتحتوي على التخصصات التالية:
- الدعوة والثقافة الإسلامية.
- الإدارة العامة.
- اقتصاديات الزكاة والوقف.
- المصارف والمؤسسات.