تعمل الكلية لتكون داراً للعلم تسعى لتحصيله وتدريسه وتطوير مناهجه وتعمل على جعل القرآن الكريم محوراً للعلم والحياة ، بدراسته ودراسة علومه وعلوم اللغة العربية ، وبالمساهمة الفاعلة في ترشيد حركة المجتمع وتثقيفه الديني ورفع مستواه وإثراء حياة الأمة السودانية بمقومات الإسلام ، وعلى وجه الخصوص :
1- تخريج متخصصين في السنة وعلومها وفي الدِّراسات الإسلامية وفي اللغة العربية مزودين بقدر وافر من المعرفة بالقرآن الكريم حفظاً وتجويداً .
2- تخريج متخصصين في الدِّراسات القرآنية وما يتصل بها من علوم .
3- إتاحة الفرصة أمام حفظة القرآن الكريم لدخول الكلية والتخصص في القراءات وعلوم القرآن .
4- تقديم البحوث والدِّراسات والمشاركة في مجالات التأصيل المختلفة .